やったことなかったので、アルゴンの分子動力学計算をやってみた。まぁ、ただのGromacsの使い方メモのような。使用したGromacsのバージョンは、4.6.1 原理的なことに関しては、分子動力学シミュレーションにおける温度・圧力制御第1回=能勢の熱浴と能勢・フ…

というのを実装して見た。リカレントニューラルネットワーク(RNN)の一形態？単純再帰型ネットワーク http://www.cis.twcu.ac.jp/~asakawa/waseda2002/elman.pdf import numpy as np def sigmoid(x): return np.tanh(x) def dsigmoid(x): return 1.0-x*x clas…

1970年頃、PerelomovやGilmoreたちが、一般のLie群に対する、generalized coherent stateという概念を考えたのだけど、有限群の場合にも、コヒーレント状態の類似物を考えられるっぽい参考)coherent state物語 http://d.hatena.ne.jp/m-a-o/20130303#p2 v_1 …

ある種の位相的場の理論(Cohomological Field Theory)の"分配関数"(数学では、descendant potentialという呼び方をする時もある)は (1)何らかの可積分階層のτ関数になっている (2)Virasoro constraintsや、より一般にW-constraintsと呼ばれる(通常、線形偏微…