2020-12-13から1日間の記事一覧

遺伝子の起源

生物が持つ遺伝子は、翻訳されて、数百〜数千アミノ酸のタンパク質になるのが一般的である。数百〜数千残基の長大なタンパク質or遺伝子が、ランダムにアミノ酸やヌクレオチドの重合を繰り返しただけで出現する確率は、普通に考えると極めて低い。ヒトの遺伝…

対数共起頻度のSVD

NLP

対数共起頻度を用いた四項類推:word2vecとPMI との比較 https://doi.org/10.11517/pjsai.JSAI2020.0_4Rin177という報告を読んだ。四項類推は、queen-woman+man ≒ kingみたいなタイプの類推問題。word2vecは、この手の問題によく答えられるということになっ…

NVIDIA Thrustで分子動力学(1)単原子分子集団のMD

MDは時々使うけど、自分で実装したことがなかったので、一回くらいは、やっておくべき気がした。実装 https://gist.github.com/vertexoperator/1d2b4c6b71138d59484665cb524143ac最初なので、相互作用はLennard-Jonesポテンシャルのみで、周期境界条件、NVE(…

Fermi推定の推定

Fermiが書いた文書My Observations During the Explosion at Trinity on July 16, 1945では、1945年7月に行われたトリニティ実験に於ける原爆のエネルギー推定を行っているが、どういう計算をしたのか詳細は書かれていない。以下に、数値情報が含まれている…